2022年10月7日,国际知名学术期刊Nature Communications在线发表了中国科学院分子植物科学卓越创新中心王二涛研究组和深圳华大生命科学院合作的题为“GWAS, MWAS and mGWAS provide insights into precision agriculture based on genotype-dependent microbial effects in foxtail millet”的研究论文。该研究以谷子为模型揭示了基因型、根系微生物组与农艺性状之间的互作网络,提出植物“农业精准微生物组”概念,为农业微生物组的精准施用奠定了理论基础。
全基因组关联研究(genome-wide association studies, GWAS)极大地促进了我们对植物基因型-表型关联的理解,但基因型往往不能完全解释种群内的表型变异。植物根系微生物群可以影响植物的表型及其对环境的适应性,被誉为植物的第二基因组,其对植物的表型和环境适应性的影响在遗传育种中被长期忽视。该研究基于827份谷子的基因型、根系生物群和生长及产量等表型数据,通过整合GWAS、微生物组关联研究(microbiome-wide association studies, MWAS)和微生物组-植物基因组关联研究(microbiome-genome association studies, mGWAS)等综合分析方法,探究了哪些“标记微生物”和哪些“标记基因”决定植物表型,对提高作物产量至关重要。
论文链接:
https://www.nature.com/articles/s41467-022-33238-4