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First report and genetic characterization of Seneca Valley virus (SVV) in Chile
Transboundary and Emerging Diseases ( IF 4.3 ) Pub Date : 2022-11-03 , DOI: 10.1111/tbed.14747
Benjamín Bennett 1 , Constanza Urzúa-Encina 1 , Catalina Pardo-Roa 2, 3, 4 , Naomi Ariyama 1 , Claudio Lecocq 5 , Carlos Rivera 5 , Catalina Badía 5 , Paulina Suárez 5 , Michel Agredo 5 , Carolina Aguayo 5 , Claudia Ávila 5 , Hugo Araya 5 , Patricio Pérez 5 , Felipe Berrios 1 , Belén Agüero 1 , Vanessa Mendieta 1 , Edviges Maristela Pituco 6 , Iassudara Garcia de Almeida 6 , Rafael Medina 2, 3, 4 , Barbara Brito 7 , Magdalena Johow 5 , Victor Neira Ramirez 1
Affiliation  

Seneca Valley virus (SVV) is a non-enveloped RNA virus and the only member of the Senecavirus A (SVA) species, in the Senecavirus genus, Picornaviridae family. SVV infection causes vesicular lesions in the oral cavity, snout and hooves of pigs. This infection is clinically indistinguishable from trade-restrictions-related diseases such as foot-and-mouth disease. Other clinical manifestations include diarrhoea, anorexia, lethargy, neurological signs and mortality in piglets during their first week of age. Before this study, Chile was considered free of vesicular diseases of swine, including SVV. In April 2022, a suspected case of vesicular disease in a swine farm was reported in Chile. The SVV was confirmed and other vesicular diseases were ruled out. An epidemiological investigation and phylogenetic analyses were performed to identify the origin and extent of the outbreak. Three hundred ninety-five samples from 44 swine farms were collected, including faeces (208), oral fluid (28), processing fluid (14), fresh semen (61), environmental samples (80) and tissue from lesions (4) for real-time RT-PCR detection. Until June 2022, the SVV has been detected in 16 out of 44 farms, all epidemiologically related to the index farm. The closest phylogenetic relationship of the Chilean SVV strain is with viruses collected from swine in California in 2017. The direct cause of the SVV introduction has not yet been identified; however, the phylogenetic analyses suggest the USA as the most likely source. Since the virus remains active in the environment, transmission by fomites such as contaminated feed cannot be discarded. Further studies are needed to determine the risk of the introduction of novel SVV and other transboundary swine pathogens to Chile.

中文翻译:

智利塞内卡谷病毒 (SVV) 的首次报告和遗传特征

塞内卡谷病毒 (SVV) 是一种无包膜 RNA 病毒,是塞内卡病毒 A (SVA) 种的唯一成员,属于塞内卡病毒属,小核糖核酸病毒科。SVV 感染会导致猪的口腔、鼻子和蹄子出现水泡性病变。这种感染在临床上无法与贸易限制相关疾病(例如口蹄疫)区分开来。其他临床表现包括仔猪第一周龄期间的腹泻、厌食、嗜睡、神经症状和死亡率。在这项研究之前,智利被认为没有猪水疱病,包括 SVV。2022 年 4 月,智利报告了一起猪场疑似水疱病病例。确认了 SVV 并排除了其他水疱性疾病。进行了流行病学调查和系统发育分析以确定爆发的起源和范围。从 44 个养猪场收集了三百九十五份样本,包括粪便(208 份)、口腔液 (28)、加工液 (14)、新鲜精液 (61)、环境样本 (80) 和病变组织 (4) 用于实时 RT-PCR 检测。到 2022 年 6 月,已在 44 个农场中的 16 个中检测到 SVV,所有农场都在流行病学上与指标农场相关。智利 SVV 毒株与 2017 年从加利福尼亚的猪身上采集的病毒最密切的系统发育关系。SVV 引入的直接原因尚未确定;然而,系统发育分析表明美国是最有可能的来源。由于病毒在环境中仍然活跃,因此不能排除通过污染饲料等污染物传播。需要进一步研究以确定将新型 SVV 和其他跨界猪病原体引入智利的风险。用于实时 RT-PCR 检测的环境样本 (80) 和病变组织 (4)。到 2022 年 6 月,已在 44 个农场中的 16 个中检测到 SVV,所有农场都在流行病学上与指标农场相关。智利 SVV 毒株与 2017 年从加利福尼亚的猪身上采集的病毒最密切的系统发育关系。SVV 引入的直接原因尚未确定;然而,系统发育分析表明美国是最有可能的来源。由于病毒在环境中仍然活跃,因此不能排除通过污染饲料等污染物传播。需要进一步研究以确定将新型 SVV 和其他跨界猪病原体引入智利的风险。用于实时 RT-PCR 检测的环境样本 (80) 和病变组织 (4)。到 2022 年 6 月,已在 44 个农场中的 16 个中检测到 SVV,所有农场都在流行病学上与指标农场相关。智利 SVV 毒株与 2017 年从加利福尼亚的猪身上采集的病毒最密切的系统发育关系。SVV 引入的直接原因尚未确定;然而,系统发育分析表明美国是最有可能的来源。由于病毒在环境中仍然活跃,因此不能排除通过污染饲料等污染物传播。需要进一步研究以确定将新型 SVV 和其他跨界猪病原体引入智利的风险。所有在流行病学上都与指标农场有关。智利 SVV 毒株与 2017 年从加利福尼亚的猪身上采集的病毒最密切的系统发育关系。SVV 引入的直接原因尚未确定;然而,系统发育分析表明美国是最有可能的来源。由于病毒在环境中仍然活跃,因此不能排除通过污染饲料等污染物传播。需要进一步研究以确定将新型 SVV 和其他跨界猪病原体引入智利的风险。所有在流行病学上都与指标农场有关。智利 SVV 毒株与 2017 年从加利福尼亚的猪身上采集的病毒最密切的系统发育关系。SVV 引入的直接原因尚未确定;然而,系统发育分析表明美国是最有可能的来源。由于病毒在环境中仍然活跃,因此不能排除通过污染饲料等污染物传播。需要进一步研究以确定将新型 SVV 和其他跨界猪病原体引入智利的风险。系统发育分析表明美国是最有可能的来源。由于病毒在环境中仍然活跃,因此不能排除通过污染饲料等污染物传播。需要进一步研究以确定将新型 SVV 和其他跨界猪病原体引入智利的风险。系统发育分析表明美国是最有可能的来源。由于病毒在环境中仍然活跃,因此不能排除通过污染饲料等污染物传播。需要进一步研究以确定将新型 SVV 和其他跨界猪病原体引入智利的风险。
更新日期:2022-11-03
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