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Bioinformatics Analysis Identifies EPAS1 as a Novel Prognostic Marker Correlated with Immune Infiltration in Acute Myeloid Leukemia
Disease Markers ( IF 3.464 ) Pub Date : 2023-4-17 , DOI: 10.1155/2023/6072782
Shichun Wang 1 , Pengyu Zhang 1
Affiliation  

EPAS1 plays an important role in the development and progression of multiple tumor types by interacting with a series of other molecules. However, the prognostic and diagnostic values of EPAS1 in acute myeloid leukemia (AML) remain unknown. Here, we systematically explored and clarified the potential functions of EPAS1 in AML using data from Xena Browser and TCGA database. The expression of EPAS1 was significantly lower in AML patients than that in healthy people. The GO, KEGG, GSEA, and GSVA were performed to explore the potential functions and signaling pathways. The survival analysis was conducted using Cox regression analysis and the Kaplan-Meier method. Immune cell infiltration was evaluated via single-sample GSEA (ssGSEA). The results of enrichment analyses suggested that low-EPAS1 expression was related to the initiation, development, and prognosis of AML. The immune microenvironment landscape in AML was described by ssGSEA. ROC analysis of EPAS1 showed high discrimination ability between AML patients and healthy people. Kaplan-Meier method indicated that low-EPAS1 expression correlated significantly with a poor overall survival. Multivariate Cox regression analysis revealed that both age and EPAS1 expression were independent prognostic factors in AML patients. Furthermore, the nomogram based on these two variables performed well in discrimination and calibration. In summary, our study may provide new insights into the molecular mechanisms underlying AML and demonstrate the diagnostic and prognostic value of EPAS1 in AML for the first time.

中文翻译:

生物信息学分析将 EPAS1 鉴定为与急性髓性白血病免疫浸润相关的新型预后标志物

EPAS1 通过与一系列其他分子相互作用,在多种肿瘤的发生和发展过程中发挥重要作用。然而,EPAS1 在急性髓性白血病 (AML) 中的预后和诊断价值仍然未知。在这里,我们使用来自 Xena 浏览器和 TCGA 数据库的数据系统地探索和阐明了 EPAS1 在 AML 中的潜在功能。EPAS1在AML患者中的表达明显低于健康人。执行 GO、KEGG、GSEA 和 GSVA 以探索潜在的功能和信号通路。使用Cox回归分析和Kaplan-Meier方法进行生存分析。通过单样本 GSEA (ssGSEA) 评估免疫细胞浸润。富集分析结果表明,EPAS1低表达与启动、发展、和 AML 的预后。ssGSEA 描述了 AML 中的免疫微环境景观。EPAS1 的 ROC 分析显示 AML 患者和健康人之间具有很高的辨别能力。Kaplan-Meier 方法表明,低 EPAS1 表达与较差的总体生存率显着相关。多变量 Cox 回归分析显示年龄和 EPAS1 表达是 AML 患者的独立预后因素。此外,基于这两个变量的列线图在辨别和校准方面表现良好。总之,我们的研究可能为 AML 的分子机制提供新的见解,并首次证明 EPAS1 在 AML 中的诊断和预后价值。EPAS1 的 ROC 分析显示 AML 患者和健康人之间具有很高的辨别能力。Kaplan-Meier 方法表明,低 EPAS1 表达与较差的总体生存率显着相关。多变量 Cox 回归分析显示年龄和 EPAS1 表达是 AML 患者的独立预后因素。此外,基于这两个变量的列线图在辨别和校准方面表现良好。总之,我们的研究可能为 AML 的分子机制提供新的见解,并首次证明 EPAS1 在 AML 中的诊断和预后价值。EPAS1 的 ROC 分析显示 AML 患者和健康人之间具有很高的辨别能力。Kaplan-Meier 方法表明,低 EPAS1 表达与较差的总体生存率显着相关。多变量 Cox 回归分析显示年龄和 EPAS1 表达是 AML 患者的独立预后因素。此外,基于这两个变量的列线图在辨别和校准方面表现良好。总之,我们的研究可能为 AML 的分子机制提供新的见解,并首次证明 EPAS1 在 AML 中的诊断和预后价值。多变量 Cox 回归分析显示年龄和 EPAS1 表达是 AML 患者的独立预后因素。此外,基于这两个变量的列线图在辨别和校准方面表现良好。总之,我们的研究可能为 AML 的分子机制提供新的见解,并首次证明 EPAS1 在 AML 中的诊断和预后价值。多变量 Cox 回归分析显示年龄和 EPAS1 表达是 AML 患者的独立预后因素。此外,基于这两个变量的列线图在辨别和校准方面表现良好。总之,我们的研究可能为 AML 的分子机制提供新的见解,并首次证明 EPAS1 在 AML 中的诊断和预后价值。
更新日期:2023-04-19
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