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个人简介

一、基本信息 张雪妍,女,1982年3月,博士,副研究员,植物基因工程及分子生物学 二、学习工作经历 1996.9--1999.6邯郸市第一中学高中 1999.9--2003.6河北大学本科 2004.9--2007.6中国农业科学院研究生院硕士研究生 2009.9--2013.6中国农业科学院研究生院博士研究生 2007.6--2015.1中国农业科学院棉花研究所助理研究员 2015.1--2019.3中国农业科学院棉花研究所副研究员 2019.3至今海南师范大学副研究员 三、科研与学术交流 棉花抗逆基因的筛选和研究 在国家自然科学基金新疆联合基金“棉花水分高效利用关键基因的挖掘及抗旱材料创制”的支持下开展相关研究,并参与了亚洲棉石系亚1号的基因组测序工作和后续的陆地棉基因组测序工作(在两篇基因组测序NatureGenetics文章中为共同作者之一)。 将石系亚1号分别在17%的PEG6000和150mMNaCl溶液水分缺失胁迫处理3h,以水培养的幼苗的相同部位作为对照材料,分析苗期根、茎、叶转录组数据变化,构建了胁迫应答调控的初步网络及应答基因的候选库。以基因候选库为基础,重点研究了转录水平明显变化的2类转录因子家族:MYB和JAZ家族,已从中筛选出一批关键功能基因用于后续的研究,并将其作为利用基因工程改良棉花抗逆性的候选基因。后续将过表达的GaJAZ1-like转化棉花,连续两年将T5代转基因棉花分别种于安阳大田、山东东营(3.12‰)和江苏盐城(2‰),以受体材料CRI24为对照。转基因材料在两年各个试验点的发芽率,长势,根长,结铃率均好于CRI24(相关工作获得自然基金青年基金资助)。其他的基因的筛选工作也在今年陆续发表(详见发表论文情况列表)。 棉花表观遗传研究 2011-2012年赴澳留学期间,开展了一些棉纤维发育的表观调控研究工作,回国后继续开展了一些相关研究工作。我们将拟南芥中组蛋白单泛素化E3连接酶AtHUB2以及棉花中其同源基因GhHUB2克隆出来并分别过表达于陆地棉CCRI24中,对其后代进行表型观察发现,HUB2的过表达不仅可增加棉花的纤维品质,并且增加的棉花的抗旱性,因此对该两种材料进行深入分析相关研究结果分别在2018年发表在植物学领域国际顶尖期刊JournalofExperimentalBotany和PlantBiotechnologyJournal。研究发现,AtHUB2过表达对棉花的生长发育无影响,而在干旱胁迫下,AtHUB2可显著增加转基因棉花的果枝数、结铃数和结铃率,显著降低棉铃的脱落率;并显著增加脯氨酸和可溶性糖含量降低水分的流失保证棉花在干旱胁迫下更好地存活。GhHUB2能够与纤维发育中起负调控作用的转录因子GhKNL1在细胞核相互作用。GhHUB2可以多聚泛素化修饰GhKNL1蛋白,并促进GhKNL1通过泛素-26S蛋白酶体途径降解。与此对应,GhHUB2超表达棉花纤维中,GhKNL1蛋白积累减少,而干扰株系中GhKNL1蛋白积累增加。棉纤维中GhHUB2对GhKNL1降解的促进,解除了GhKNL1对下游参与纤维伸长和次生壁合成基因的转录抑制,提高了相关基因的表达,从而调控纤维的发育。GhHUB2和GhKNL精细调控棉纤维发育,维持纤维发育的内稳态。所以,超表达株系中,纤维长度、细胞壁厚度以及纤维素和木质素的含量、纤维强度相对于对照均显著提高;相反,干扰株系中相关指数显著降低。 五、其他工作 2010年“棉花组织培养性状纯化及外源基因功能验证平台构建”获得了国家技术发明二等奖(第五获奖人) 2013年获得安阳市新长征突击手荣誉称号 2017年获得2016-2017年度神农中华农业科技奖优秀创新团队(第三获奖人)

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公开发表SCI收录40篇,其中第一作者或者共同第一作者论文7篇,累计影响因子29.703;通讯或者共同通讯作者论文8篇,累计影响因子53.121。所有SCI论文,包括一作,通讯作者和参与作者,累计影响因子达到301.819。 FengH,LiX,ChenH,DengJ,ZhangC,LiuJ,WangT,ZhangX§(共同通讯作者),,DongJ.*.(2018)GhHUB2,aubiquitinligase,isinvolvedincottonfiberdevelopment.JournalofExperimentalBotany,69:5059-5075(correspondingauthor,共同通讯作者,SCI收录,发表当年影响因子5.354). ZhangB,LiuJ,YangZE,ChenEY,ZhangCJ,ZhangXY§(共同通讯作者),LiFG*.(2018)Genome-wideAnalysisofGRASTranscriptionFatorGenefamilyinGossypiumhirsutumL.BMCGenomics,19:348(correspondingauthor,共同通讯作者,SCI收录,发表当年影响因子3.730). WangX,ChenE,GeX,GongQ,ButtH,ZhangC,YangZ,LiF*,ZhangX§(共同通讯作者).(2018)OverexpressedBRH1,aRINGfingergene,altersrosetteleafshapeinArabidopsisthalianaSciChinaLifeSci.61(1):79-87.(correspondingauthor,共同通讯作者,SCI收录,发表当年影响因子3.085) ButtHI,YangZ,GongQ,ChenE,WangX,ZhaoG,GeX,ZhangX§(共同通讯作者),LiF*.(2017)GaMYB85,anR2R3MYBgene,intransgenicArabidopsisplaysanimportantroleindroughttolerance.BMCPlantBiology,17:142(correspondingauthor,共同通讯作者,SCI收录,发表当年影响因子3.930). LiuZ,GeX,YangZ,ZhangC,ZhaoG,ChenE,LiuJ,ZhangX§(共同通讯作者),,LiF*.(2017)Genome-wideidentificationandcharacterizationofSnRK2genefamilyincotton(GossypiumhirsutumL.).BMCGenetics,18:54(correspondingauthor,共同通讯作者,SCI收录,发表当年影响因子2.469). ChenE,WangX,GongQ,ButtHI,ChenY,ZhangC,YangZ,WuZ,GeX,ZhangX,LiF,ZhangX*(通讯作者).(2017)AnovelGhBEE1-LikegeneofcottoncausesantherindehiscenceintransgenicArabidopsisunderuncontrolledtranscriptionlevel.Gene.627:49-56(correspondingauthor,通讯作者,SCI收录,发表当年影响因子2.498). SongY§,ZhaoG§,ZhangX§(共同第一作者),LiL,XiongF,ZhuoF,ZhangC,YangZ,DatlaR,RenM,LiF.(2017)ThecrosstalkbetweenTargetofRapamycin(TOR)andJasmonicAcid(JA)signalingexistinginArabidopsisandcotton.SciRep.7:45830.(jointfirstauthors,SCI收录,发表当年影响因子4.122). ChenE§,ZhangX§(共同第一作者),YangZ§,WangX§,YangZ,ZhangC,WuZ,KongD,LiuZ,ZhaoG,ButtHI,ZhangX,LiF.*.(2017)Genome-wideanalysisoftheHD-ZIPIVtranscriptionfactorfamilyinGossypiumarboreumandGaHDG11involvedinosmotictoleranceintransgenicArabidopsis.MolecularGeneticsandGenomics,292:1-17.(jointfirstauthors,SCI收录,发表当年影响因子2.734). ButtHI,YangZ,ChenE,ZhaoG,GongQ,YangZ,ZhangX*(共同通讯作者),LiF*,(2017),FunctionalCharacterizationofCottonGaMYB62L,aNovelR2R3TFinTransgenicArabidopsis.PLoSOne.12(1):e0170578.(correspondingauthor,共同通讯作者,SCI收录,发表当年影响因子2.766). ZhaoG,SongY,WangC,ButtHI,WangQ,ZhangC,YangZ,LiuZ,ChenE,ZhangX*(共同通讯作者),LiF*.(2016)Genome-wideidentificationandfunctionalanalysisoftheTIFYgenefamilyinresponsetodroughtincotton.MolGenetGenomics,291:2173-2187.(Co-correspondingauthor,共同通讯作者,SCI收录,发表当年影响因子2.728). WangY§,LiangC§,WuS§,ZhangX§(共同第一作者),TangJ,JianG,JiaoG,LiF,ChuC.(2016)SignificantImprovementofCottonVerticilliumWiltResistancebyManipulatingtheExpressionofGastrodiaAntifungalProteins.MolecularPlant,9:1436-1439(jointfirstauthors,SCI收录,发表当年影响因子8.827). ZhengW§,ZhangX§(共同第一作者),YangZ,WuJ,LiF,DuanL,LiuC,LuL,ZhangC*,LiF*.(2014).AtWuschelPromotesFormationoftheEmbryogenicCallusinGossypiumhirsutum.PLoSOne,9:e87502(jointfirstauthors,SCI收录,发表当年影响因子3.234). ZhangX,YaoD,WangQ,XuW,WeiQ,WangC,LiuC,ZhangC,YanH,LingY,SuZ*,LiF*(2013)mRNA-seqanalysisoftheGossypiumarboreumtranscriptomerevealstissueselectivesignalinginresponsetowaterstressduringseedlingstage,PLoSOne,8:e54762(firstauthor,SCI收录,发表当年影响因子3.534). YaoD§,ZhangX§(共同第一作者),ZhaoX§,LiuC,WangC,ZhangZ,ZhangC,WeiQ,WangQ,YanH,LiF*SuZ*.(2011)Transcriptomeanalysisrevealssalt-stress-regulatedbiologicalprocessesandkeypathwaysinrootsofcotton(GossypiumhirsutumL.).Genomics,98:47-55(jointfirstauthors,SCI收录,发表当年影响因子2.911). TianJ§,ZhangX§(共同第一作者),LiangB,LiS,WuZ,WangQ,LengC,DongJ*,WangT.(2010).ExpressionofBaculovirusAnti-apoptoticGenesp35andop-iapinCotton(GossypiumhirsutumL.)EnhancesTolerancetoVerticilliumWilt.PLoSOne,5:e14218(jointfirstauthors,SCI收录,发表当年影响因子4.351). ZhangL,LiFG,LiuCL,ZhangCJ,ZhangX.(2009).Constructionandanalysisofcotton(GossypiumarboreumL.)drought-relatedcDNAlibrary.BMCResNotes.2:120.(SCI收录,发表当年影响因子2.350) WuX,LiF,ZhangC,LiuC,ZhangX.(2009).DifferentialgeneexpressionofcottoncultivarCCRI24duringsomaticembryogenesis.JPlantPhysiol.166(12):1275-83.(SCI收录,发表当年影响因子2.065). ChenH,FengH,ZhangX,ZhangC,WangT*,DongJ*.(2018)AnArabidopsisE3ligaseHUB2,increaseshistoneH2Bmonoubiquitinationandenhancesdroughttoleranceintransgeniccotton.PlantBiotechnologyJournal,2018,1-13,(SCI收录,发表当年影响因子6.305). WangP,SunY,PeiY,LiX,ZhangX,LiF,HouY.(2018)GhSNAP33,at-SNAREProteinFromGossypiumhirsutum,MediatesResistancetoVerticilliumdahliaeInfectionandTolerancetoDroughtStress.FrontPlantSci.;9:896.(SCI收录,发表当年影响因子3.678). DuX,HuangG,HeS,YangZ,SunG,MaX,LiN,ZhangX,SunJ,LiuM,JiaY,PanZ,GongW,LiuZ,ZhuH,MaL,LiuF,YangD,WangF,FanW,GongQ,PengZ,WangL,WangX,XuS,ShangH,LuC,ZhengH,HuangS*,LinT,ZhuY*,LiF*.(2018)Resequencingof243diploidcottonaccessionsbasedonanupdatedAgenomeidentifiesthegeneticbasisofseveralkeyagronomictraits.NatureGenetics,50:796–802.(SCI收录,发表当年影响因子27.125). LiuN,SunY,PeiY,ZhangX,WangP,LiX,LiF,HouY.(2018)APectinMethylesteraseInhibitorEnhancesResistancetoVerticilliumWilt.PlantPhysiol.176(3):2202-2220.(SCI收录,发表当年影响因子5.949). GongQ,YangZ,ChenE,SunG,HeS,ButtHI,ZhangC,ZhangX,YangZ,DuX,LiF.(2018).APhi-ClassGlutathioneS-TransferaseGeneforVerticilliumWiltResistanceinGossypiumarboreumIdentifiedinaGenome-WideAssociationStudy.PlantCellPhysiol.59(2):275-289(SCI收录,发表当年影响因子4.059). YouQ,YiX,ZhangK,WangC,MaX,ZhangX,XuW,LiF,SuZ.(2017)Genome-widecomparativeanalysisofH3K4me3profilesbetweendiploidandallotetraploidcottontorefinegenomeannotation.SciRep.7(1):9098.(SCI收录,发表当年影响因子4.122). WangP,ZhangX,MaX,SunY,LiuN,LiF,HouY.(2017)IdentificationofCkSNAP33,ageneencodingsynaptosomal-associatedproteinfromCynanchumkomarovii,thatenhancesArabidopsisresistancetoVerticilliumdahliae.PLoSOne.12(6):e0178101.(SCI收录,发表当年影响因子2.766). GongQ,YangZ,WangX,ButtHI,ChenE,HeS,ZhangC,ZhangX,LiF.(2017)Salicylicacid-relatedcotton(Gossypiumarboreum)ribosomalproteinGaRPL18contributestoresistancetoVerticilliumdahliae.BMCPlantBiol.17(1):59.(SCI收录,发表当年影响因子3.930) YouQ,YiX,ZhangK,WangC,MaX,ZhangX,XuW,LiF,SuZ.(2017)Genome-widecomparativeanalysisofH3K4me3profilesbetweendiploidandallotetraploidcottontorefinegenomeannotation.SciRep.7(1):9098.(SCI收录,发表当年影响因子4.122) LiuN,ZhangX,SunY,WangP,LiX,PeiY,LiF,HouY.(2017)Molecularevidencefortheinvolvementofapolygalacturonase-inhibitingprotein,GhPGIP1,inenhancedresistancetoVerticilliumandFusariumwiltsincotton.SciRep.7:39840.(SCI收录,发表当年影响因子4.122) YouQ,XuW,ZhangK,ZhangL,YiX,YaoD,WangC,ZhangX,ZhaoX,ProvartNJ,LiF,SuZ.(2017)ccNET:Databaseofco-expressionnetworkswithfunctionalmodulesfordiploidandpolyploidGossypium.NucleicAcidsRes.45(D1):D1090-D1099.(SCI收录,发表当年影响因子11.561) YouQ,ZhangL,YiX,ZhangK,YaoD,ZhangX,WangQ,ZhaoX,LingY,XuW,LiF,SuZ.(2016)Co-expressionnetworkanalysesidentifyfunctionalmodulesassociatedwithdevelopmentandstressresponseinGossypiumarboreum.SciRep.6:38436.(SCI收录,发表当年影响因子4.337) LiL,SongY,WangK,DongP,ZhangX,LiF,LiZ,RenM.(2015)TOR-inhibitorinsensitive-1(TRIN1)regulatescotyledonsgreeninginArabidopsis.FrontPlantSci.6:861.(SCI收录,发表当年影响因子3.948). LiF,FanG,LuC,XiaoG,ZouC,KohelRJ,MaZ,ShangH,MaX,WuJ,LiangX,HuangG,PercyRG,LiuK,YangW,ChenW,DuX,ShiC,YuanY,YeW,LiuX,ZhangX,LiuW,WeiH,WeiS,HuangG,ZhangX,ZhuS,ZhangH,SunF,WangX,LiangJ,WangJ,HeQ,HuangL,WangJ,CuiJ,SongG,WangK,XuX,YuJZ,ZhuY,YuS.(2015)GenomesequenceofcultivatedUplandcotton(GossypiumhirsutumTM-1)providesinsightsintogenomeevolution.NatBiotechnol.33(5):524-30.(SCI收录,发表当年影响因子41.514). XuZ,ZhangC,GeX,WangN,ZhouK,YangX,WuZ,ZhangX,LiuC,YangZ,LiC,LiuK,YangZ,QianY,LiF.(2015)Constructionofahigh-densitylinkagemapandmappingquantitativetraitlociforsomaticembryogenesisusingleafpetiolesasexplantsinuplandcotton(GossypiumhirsutumL.).PlantCellRep.34(7):1177-1187.(SCI收录,发表当年影响因子3.071). GeX,ZhangC,WangQ,YangZ,WangY,ZhangX,WuZ,HouY,WuJ,LiF.(2015)iTRAQproteinprofiledifferentialanalysisbetweensomaticglobularandcotyledonaryembryosrevealsstress,hormone,andrespirationinvolvedinincreasingplantletregenerationofGossypiumhirsutumL.JProteomeRes.14(1):268-78.(SCI收录,发表当年影响因子5.088). BelloB,ZhangX,LiuC,YangZ,YangZ,WangQ,ZhaoG,LiF.(2014)CloningofGossypiumhirsutumsucrosenon-fermenting1-relatedproteinkinase2gene(GhSnRK2)anditsoverexpressionintransgenicArabidopsisescalatesdroughtandlowtemperaturetolerance.PLoSOne.9(11):e112269.(SCI收录,发表当年影响因子3.534). LiF§,FanG§,WangK§,SunF§,YuanY,SongG,LiQ,MaZ,LuC,ZouC,ChenW,LiangX,ShangH,LiuW,ShiC,XiaoG,GouC,YeW,XuX,ZhangX,WeiH,LiZ,ZhangG,WangJ,LiuK,KohelRJ,PercyRG,YuJZ,ZhuYX,WangJ,YuS.(2014).GenomesequenceofthecultivatedcottonGossypiumarboreum.NatureGenetics46:567-573.(SCI收录,发表当年影响因子29.352). YangZ,LiC,WangY,ZhangC,WuZ,ZhangX,LiuC,LiF.(2014).GhAGL15s,preferentiallyexpressedduringsomaticembryogenesis,promoteembryogeniccallusformationincotton(GossypiumhirsutumL.).MolGenetGenomics.289(5):873-83.(SCI收录,发表当年影响因子2.831) YangZ,ZhangC,YangX,LiuK,WuZ,ZhangX,ZhengW,XunQ,LiuC,LuL,YangZ,QianY,XuZ,LiC,LiJ,LiF.(2014)PAG1,acottonbrassinosteroidcatabolismgene,modulatesfiberelongation.NewPhytol.203:437-48.(SCI收录,发表当年影响因子6.373). XuZ,ZhangC,ZhangX,LiuC,WuZ,YangZ,ZhouK,YangX,LiF(2013)TranscriptomeprofilingrevealsauxinandcytokininregulatingsomaticembryogenesisindifferentsisterlinesofcottoncultivarCCRI24,JIntegrPlantBiol.,55(7):631-42.(SCI收录,发表当年影响因子3.75). WangK§,WangZ§,LiF§,YeW§,WangJ§,SongG§,YueZ,CongL,ShangH,ZhuS,ZouC,LiQ,YuanY,LuC,WeiH,GouC,ZhengZ,YinY,ZhangX,LiuK,WangB,SongC,ShiN,KohelRJ,PercyRG,YuJZ,ZhuYX,WangJ,YuS.(2012).ThedraftgenomeofadiploidcottonGossypiumraimondii.NatureGenetics44:1098-1104.DOI.10.1038/ng.2371(SCI收录,发表当年影响因子35.209) WangQ,ZhangX,LiF,HouY,LiuX,ZhangX.(2011)IdentificationofaUDP-glucosepyrophosphorylasefromcotton(GossypiumhirsutumL.)involvedincellulosebiosynthesisinArabidopsisthaliana.PlantCellRep.30(7):1303-12.(SCI收录,发表当年影响因子2.279).

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