1. 环境微生物基础研究。宿主（植物、土壤动物、鱼类等）与微生物之间的互相作用，包括 ①宿主对微生物群落结构的改造、微生物对宿主生长、免疫、生殖等多方面的影响；②微生物群落内部的互相作用；③微生物造成的环境健康风险等；

2. 环境因素对微生物群落、鱼类、植物、土壤动物及其互相作用的影响，环境因素可包括污染物、营养元素、气候变化等。

3. 主要研究的对象是土壤微生态和水生微生态，虽然对象不同，但两种体系所对应的研究思路和测试分析方法有许多相同或相似之处。因此，每位同学虽然分工不同，但会同时接触到这两类的研究，大家平时会互相交流，开拓实验思路。

4. 研究意义。生态学和毒理学研究属于基础研究，可以 ①解析生物间物质循环和信息传递的分子机制；②研究微生物对植物、土壤动物、鱼类生长过程的影响，为农业生产提供指导；③研究微生态系统对污染物（农药、抗生素、重金属等）或气候变化的响应和耐受阈值，找到相应的环境评价指标，利于制定环境保护政策；④对潜在生态风险（即将上市的新材料、新药品等对环境微生态是否有危害）进行预测。

土壤微生态系统介绍

① 植物的根际、叶际、以及植物体内，都会富集特定的微生物，这些微生物统称为植物微生物组；

②这些微生物来自环境（土壤、空气），但经过植物体塑造，这些微生物群落与环境微生物的组成已经大不相同了；

③ 这些微生物会影响植物的营养摄取、免疫等功能，从而影响植物的生长、生殖过程；

④ 环境因素（污染物、气候变化等）会影响植物与微生物互相作用。

⑤土壤动物种类丰富，数量众多，据估计约占世界上被描述过的动物的23%。他们参与自然界中的营养和物质循环，一些小型的土壤无脊椎动物经常用作土壤生态风险评估的指示生物；

⑥土壤无脊椎动物肠道内会富集特定的微生物组，帮助维持宿主的健康和生理内稳态；

⑦环境因素（污染物、气候变化等）会影响土壤动物与微生物互相作用。

水生微生态系统介绍

①水中的真核藻类、蓝藻、细菌、真菌、病毒、浮游动物等，共同构成水生微生态。

② 鱼类的肠道微生物也来自水体的微生物；微生物可影响鱼类健康；

③ 环境因素会影响水生生态的稳定性。